SNP genotypes from upstream of the HLA-DNA gene to the TAP2 gene in the Class II region of the MHC

The location of each SNP (centromeric to telomeric) is given relative to the first SNP, DA1+/-. Each SNP is classified by type:

Genotypes of each SNP in a panel of 50 unrelated UK Caucasian semen donors, established by ASO hybridisation of genomic PCR products, are given as single allele letters for homozygotes and H for heterozygotes. Uncertain genotypes are marked ? and undetermined genotypes indicated with a dot. Most of these SNPs were discovered by resequencing donors 1-8.

 

To download a pdf version of this page, click here.

                                 Semen donor:
                                                   1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 5
SNP        location     type     1 2 3 4 5 6 7 8 9 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 0

DA1+/-            1       ID     H + H H H H + + + + + H + + + + H + H + H - + + H - + + + H + H H - + + H + H - + H + + H + + + H H
DA3A/G          556      CTi     A H A A A A A A H A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A H
DA5G/A         1907       Ti     H G H H H A G G G G G H H G G G H G H G H A G G H A G G H H G H H A G G H G H A G H H G H A G G H H
DA9+/-         2292       ID     H H H H H - + + H + H H H + + + H + H + H - + + H - + + H H + H H - + + H + H - + H H + H - + + H -
DB1A/G         5402       Ti     H A H H H G A A A A A H A A A A H A H A H G A A H G A A A H A H H G A A H A H G A H H A H A A A H H
DB2C/T         7201       Ti     H C H H H T C C C C C H H C C C H C H C H T C C H T C C H H C H H T C C H C H T C H H C H T C C H H
DC1A/C        11741       Tv     H C C H H H A H C A H H C A A A H H C A C C A A H C H A H H A H H C A A H H H C A H H A H H A A C C
DC3+/-        11972       ID     H + + + + + + H + + + + + + H + H + + + + + + H + + + + + + + + + + H + + + + + + + + + + + + + + +
DC8A/T        13807       Tv     H H H A H H A A H A A H T A A A H H H A H T A A H H A A H H A H H H A A H H H T A A H A H H A A H H
DC9A/G        13964       Ti     H H G H H G A H H A A H G A A A H H G A G G A A H G H A H H A H H G A A H H H G A H H A H G A A G H
DC10G/C       13995       Tv     G G H H G G G H G G G G G G G G G G H G H G G G G H H G G G G G G H G G G G G G G H G G G G G G H G
DD1aG/C       17276       Tv     C C C H C C G C C H H H C H C C C H C G C C H H C C H G H H H C H C C H C C C C H C C H H C H H C C
DD1b+/-       17278       ID     + + H H + + + H + + + + + + + + + + H + H + + + + H H + + + + + + H + + + + + + + H + + + + + + H +
DD2aT/G       17459       Tv     H H G H H H T H H T T H G T T T H H G T G G T T H G H T H H T H H G T T H H H G T H H T H H T T G H
DD2bT/C       17461      CTi     H H C H H H T H H T T H C T T T H H C T C C T T H C H T H H T H H C T T H H H C T H H T H H T T C H
DD7T/C        17951       Ti     H T T T T H T T T T T T T T H T H T T T T T T H T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T H T T T T
DD15A/C       18586       Tv     H H C H H H A H H A A H C A A A H H C A C C A A H C H A H H A H H C A A H H H C A H H A H H A A C H
DD19-/+       18603       ID     H H + H H H - H H - - H + - - - H H + - + + - - H + H - H H - H H + - - H H H + - H H - H H - - + H
DD20-/+       18821       ID     H H + H H H - H H - - H + - - - H H + - + + - - H + H - H H - H H + - - H H H + - H H - H H - - + H
DD21+/-       19064       ID     H H - H H H + H H + + H - + + + H H - + - - + + H - H + H H + H H - + + H H H - + H H + H H + + - H
DD22T/C       19070       Ti     H H C H H ? T H H T T H C T T T H H C T C C T T H C H T H H T H H C T T H H H C T H H T H H T T C H
DD23A/T       19110       Tv     A A A A A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A H A A A A
DD16G/A       19115       Ti     H H A H H H G H H G G H A G G G H H A G A A G G H A H G H H G H H A G G H H H A G H H G H H G G A H
DD17T/C       19120       Ti     H H C H H H T H H T T H C T T T H H C T C C T T H C H T H H T H H C T T H H H C T H H T H H T T C H
DD24G/T       19191       Tv     G G G G H G G G G H G G G H H H G G G G G G H G H G G G G G H H G G H H G H H G G H H H G G H H G G
DD18T/C       19193       Ti     H H C H H H T H H T T H C T T T H H C T C C T T H C H T H H T H H C T T H H H C T H H T H H T T C H
DD9G/T        19817       Tv     T T T H T T G T T H H H T H T H T H T G T T H H T T H G H H H T H T T H H T T T G T T H H T H H T T
DD10C/G       20027       Tv     H H H C H H C C H C C H G C C C H H H C H G C C H H C C H H C H H H C C H H H G C C H C H H C C H H
DD11T/C       20051      CTi     H H C H H H T H H T T H C T T T H H C T C C T T H C H T H H T H H C T T H H H C T H H T H H T T C H
DD12C/G       20118       Tv     H C C C C H C H C C C C C C H C H C C C C C C H C C C C C C C C C C H C C C C C C C C C C H C C C C
DD13C/T       20120      CTi     C C C C C H C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C H C C C C
DD14A/G       20188      CTi     H H G H H H A H H A A H G A A A H H G A G G A A H G H A H H A H H G A A H H H G A H H A H H A A G H
DE1C/G        20647       Tv     H C H H C H C H C C C C C C H C H C H C H C C H C H H C C C C C C H C C C C C C C H C C C H C C H C
DE2G/A        20800      CTi     G G H G G H G G H G G H G G G G H G G G G H G G G G G G H G G G G G G G H H H H G G G G H G G G G G
DE3G/T        21211       Tv     G H G G G G G H G G G G H G G G G H G G H G G G G G G G G G G G G G H G G G G G G G G G G G G G G G
DE4C/T        21242       Ti     C C H C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C
DE5G/T        21470       Tv     G H G G G G G G H G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G H
DE6C/T        21583       Ti     H C C C H H C C C C C C H C C C C C H C C H C C H H C C C H C H H H C C C C C H C C H C C T C C H H
DE7A/G        21620      CTi     H A A A H H A A A A A A H A A A A A H A A H A A H H A A A H A H H H A A A A A H A A H A A G A A H H
DE8A/C        21946       Tv     A A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A
DE9T/C        22263       Ti     H H C H H H T C H H T H H H C H C H H T C H H H H H H T H T H H T H C H H C C H T C H H H T H H H T
DE10A/C       22378       Tv     C C C H C C A C C H A H C H C H C H C A C C H H C C H A H H H C H C C H H C C C A C C H H C H H C C
DE11G/C       22450       Tv     G G H G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G
DE12T/C       22483       Ti     T H H H T T T C H T T T T T T T T T H T H T T T T H H T T T T T T H H T T T T T T H T T T T T T H H
DE13C/T       22714       Ti     C C H C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C
DE14C/T       22754      CTi     C C H H C C C H C C C C C C C C C C H C H C C C C H H C C C C C C H C C C C C C C H C C C C C C H C
DE15T/G       22889       Tv     G H H H G H T H H H T T H H G H H T G T H H H H G G H T T H H G H G H H T H H H T G G H T G H H G G
DE16C/A       23039       Tv     A A H H H A C A A C C H A C H C A H A C A A C H H A H C H H C H H A H C H H H A C H H C H A C C A A
DE17C/T       23144       Ti     C C H H C C C H C C C C C C C C C C H C H C C C C H H C C C C C C H C C C C C C C H C C C C C C H C
DE18C/T       23614       Ti     C C C C C H C C C C C C H C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C H C C C C
DE19A/T       23651       Tv     A A A A A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A H A A A A
DE20T/C       23929      CTi     C C C H C C T C C H T H C H C H C H C T C C H H C C H T H H H C H C C H H C C C T C C H H C H H C C
DE21T/C       24078       Ti     C C C H C C T C C H T H C H C H C H C T C C H H C C H T H H H C H C C H H C C C T C C H H C H H C C
DE22C/G       24099       Tv     H C H C H C C C C C C C C C C C C C H C C H C C H H C C C H C H H H C C C C C H C C H C C H C C H H
DE23A/G       24220      CTi     H A A A H A A A A A A A A A A A A A H A A H A A H H A A A H A H H H A A A A A H A A H A A H A A H H
DE24C/T       24287       Ti     C H C C H H C C H H C H H H H H H H C C H H H C H C C C H C H H C C H H H T T H C H H H H C H H C C
F1C/T         24416       Ti     H T C C H H C H T C C H H H T H T H C C H H H H H C C C H C H H C C T H H T T H C H H H H C H H C H
F2A/G         24541       Ti     H G H H H G A G G H A H G H G H G H H A G H H H H H H A H A H H A H G H H G G H A G H H H H H H H H
F3G/A         24784      CTi     H A H H H A G A A H G H A H A H A H H G A H H H H H H G H G H H G H A H H A A H G A H H H H H H H H
F4T/C         24864       Ti     C C C H C C T C C H H H C H C C C H C T C C H H C C H T H H H C H C C H C C C C H C C H H C H H C C
F10G/A        24955      CTi     H G G G H G G G G G G G G G G G G G H G G H G G H H G G G H G H H H G G G G G H G G H G G H G G H H
F11C/A        25247       Tv     C C C C C H C C H C C H C C C C H C C C C H C C C C C C H C C C C C C C H C H H C C C C H C C C C C
F5A/C         25397       Tv     A C H H H C A C C H A H H H H H H H H A C H H A H H H A H A H H A H C H H H C H A C H H H H H H H H
F6G/A         25455       Ti     G G G G G G G A G G G G G G G G G G H G G G G G G G H G G G G G G G H G G G G G G G G G G G G G H G
F7G/A         25530      CTi     H A H H H H G A H H G H H H A H A H H G A H H H H H H G H G H H G H A H H H A H G A H H H G H H H H
F8A/G         25717       Ti     H G H H H G A G G H A H H H G H G H H A G H H H H H H A H A H H A H G H H H G H A G H H H H H H H H
F9-/+         25810       ID     H + H H H + - + + H - H H H + H + H H - + H H H H H H - H - H H - H + H H H + H - + H H H H H H H H
FG1A/G        25919      CTi     A A A A H A A A A H A A A H H H A A A A A A H A H A A A A A H H A A H H A H H A A H H H A A H H A A
FG2C/T        25956       Ti     H C H C H H C C C C C C H C C C C C H C C H C C H H C C C H C H H H C C C C C H C C H C C T C C H H
FG3G/A        26198       Ti     H G G G H G G G G G G G G G G G G G H G G H G G H H G G G H G H H H G G G G G G G G H G G H G G H H
FG4G/C        26284       Tv     C C H H H C G C C G G H C G H G C H C G C C G H H C H G H H G H H C H G H G G C G H H G H C G G C C
FG5A/T        26534       Tv     H A H H T H A A A H A A A H H H A A T H H H H A H T A A A H H T H T T H H H H H H T T H A T H H T H
FG6C/T        26894      CTi     H C C C H C C C C C C C C C C C C C H C C H C C C H C C C H C H H H C C C C C C C C H C C H C C H H
FG7C/T        26910      CTi     T H H C H C C H H C H C C C H H H C T C C H C H C H H C C H C H H H C C H C C C H C H C C H C C T T
FG8A/G        27393       Ti     H A H A A A A A A A A A A A H A H A A A A A A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A
FG9G/A        27590       Ti     H G H G G G G G G G G G G G H G H G G G G G G H G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G
FG10C/T       27634      CTi     H C H C C C C C C C C C C C H C H C C C C C C H C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C
G1C/T         28089       Ti     H C C C H C C T C C H C C C C C C C T C C H C C H H H C C H C H H H H C H C C C H C H C C H C C T H
G2-/+         28251       ID     H - H - - - - - - - - - - - H - H - - - - - - H - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
G6A/G         28647      CTi     A A A A A H A A A A A A A A H A A A A H A A A A A A A A A A A A A A A A A H H A A A H A A H A H A A
G7G/A         28689      CTi     G H G G G G G G H G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G H
G3A/G         28926       Ti     A G A A A A A A H A A A H A A A A H A A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A H
G4aC/T        28932      CTi     C H C C C C C C H C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C H
G4bT/A        28936       Tv     T T T T T H T T T T T T T T H T T T T H T T T T T T T T T T T T T T T T T H H T T T H T T H T H T T
G5C/T         29080       Ti     C T C C C C C C H C C C H C C C C H C C H C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C H
GA1C/T        29347      CTi     T T H C H H C H T C H H T C T C T H H H H T C H H H C C H H C H H H H C T H T H H C T C H T C H H T
GA3T/A        29436       Tv     H T H T T T T T T T T T T T H T H T T T T T T H T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T
GA4-/+        29527       ID     H - - - H - - H - - H - - - - - - - H - - H - - H H - - - H - H H H H - H - - - H - H - - H - - H H
GA5C/T        29598      CTi     H C H C C C C C C C C C C C H C H C C C C C C H C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C
GA6G/A        30338       Ti     H A H G G H G G A G G H A G A G A H G H H H G H G G G G H G G G G G G G H H A H G G H G H H G H G H
GA7G/T        30405       Tv     G T G G G G G G T G G H T G G G H H G G H H G G G G G G H G G G G G G G H G H H G G G G H G G G G H
GA8C/T        30668       Ti     C T C C C H C C T C C H T C H C H H C H H H C C C C C C H C C C C C C C H H T H C C H C H H C H C H
GA9A/C        30866       Tv     A C A A A H A A C A A H C A H A H H A H H H A A A A A A H A A A A A A A H H C H A A H A H H A H A H
GA10C/T       30939       Ti     C T C C C C C C T C C H T C C C H H C C H H C C C C C C H C C C C C C C H C H H C C C C H C C C C H
GA11G/A       31102       Ti     G A G G G H G G A G G H A G H G H H G H H H G G G G G G H G G G G G G G H H A H G G H G H H G H G H
GA12C/T       31197       Ti     C T C C C C C C T C C H T C C C H H C C H H C C C C C C H C C C C C C C H C H H C C C C H C C C C H
A1C/T         31309      CTi     C T C C C C C C H C C C H C C C C H C C H C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C H
A2A/G         31352       Ti     H A H A A A A A A A A A A A H A H A A A A A A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A
A3C/G         31457       Tv     C C C C C H C C C C C C C C H C C C C H C C C C C C C C C C C C C C C C C H H C C C H C C H C H C C
A4C/T         31520       Ti     C T C C C H C C H C C H T C H C H H C H H H C C C C C C H C C C C C C C H H T H C C H C H H C H C H
A5C/T         31660       Ti     C H C C C C C C C C C C H C C C C H C C H C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C
A6+/-         31858       ID     + - + + + H + + - + + H - + H + H H + H H H + + + + + + H + + + + + + + H H - H + + H + H H + H + H
A7C/G         31882       Tv     C G C C C H C C G C C H G C H C H H C H H H C C C C C C H C C C C C C C H H G H C C H C H H C H C H
A11+/-        32034       ID     H + + + H + + H + + H + + + + + + + H + + - + + H H + + + H + H H H H + - + + + H + H + + H + + H H
A12C/G        32055       Tv     C G C C C H C C G C C H G C H C H H C H H H C C C C C C H C C C C C C C H H G H C C H C H H C H C H
A13C/A        32562       Tv     H C H C C C C C C C C C C C H C H C C C C C C H C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C
A9T/C         33090      CTi     T C T T T T T T H T T T H T T T T H T T H T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T H
A10T/C        33432       Ti     T C T T T H T T C T T H C T H T H H T H H H T T T T T T H T T T T H T T H H C H T H H T H H T H T H
AB1C/T        33850       Ti     H H C C C C C H C C H C H C H H H H C C C H C H H H C C H H C H H T H C H C C C H C H C C H C C C H
AB2G/T        34003       Tv     G H G G G H G H G G G H G G H G G G H G G G G G G G H G G G G G G G G G G H T H G H H G H H G G H H
AB3T/C        34044       Ti     T T H T T T T T T T T T H T H T H T T T T T T H T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T
AB4T/C        34089      CTi     T T H T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T
AB12C/A       34407       Tv     C C C C C C C H C H C C C C C C C H C H H C C C H C C C H H C H H C C C C H H C C C H C C H C C C H
AB5T/C        34410       Ti     T T T T T T T H T H T T T T T T T H T H H T T T H T T T H H T H H H T T T H H T T T H T T H T T T C
AB13C/A       34423       Tv     C C C C C C C C C C C C C C C C C H C C C C C C C C C C H C C H C H C C C C H C C C C C C C C C C A
AB14C/T       34706       Ti     C C C C H H C C C H C C C H C C C C C C H H H C H C C C H C H T C H H C C C H C C H C H H C T C C H
AB8T/C        34729       Ti     T T T T T T H H T T T T T T T T T T T T T H T T H T H C T T T H T H T H T T T T H T H T H T H T T H
AB9T/C        34824       Ti     T T H T T T H T T T T T T T C T C T T C H T H H H T T C T T H T T T T H T H T C H H C T C T T H T T
AB10G/C       34855       Tv     G G H G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G
AB11-/+       34947       ID     - - - - - H - - - - - - H - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AB6A/T        35095       Tv     H T T H H H A H H H H A T T T T T T H T H H A H T A H H H A T T A T T H H H H T H A T T H A T H H H
B2G/A         35522       Ti     G H A G G G G H H G H G G H H H G G H A G G G G H G H H G G H G G G G G G H G A G G H H G G G H H G
B3A/G         35535       Ti     H A A A A H A A A A A A A A A A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A
B4-/+         35594       ID     H + + H - H - H H - H - H + H H H H H + - - - - H - H H - - H - - H H H H H - + H - H H - - - H H -
B8C/A         35843       Tv     C H C H C C C C C C C C H H C C C H C C C C C C C C C C C C C C C H C H C C C C C C C C C C C C C C
B9G/A         36007      CTi     G G G G H H G G G H G G H G H H H H G G H H G H H G G G H G H A G H H G G G H G G G H H H G A G G H
B10-/+        36501       ID     - H + - - - - H H - H - - H H H - - H + - - - - H - H H - - H - - - - - - H - + - - H H - - - H H -
B5T/C         36968       Ti     H C C H H C T H H H H T C C C C C C H C H H T H C T ? H H T C C T C C H H H H C H T C C H T C H ? ?
B6G/A         37003      CTi     G H A G H H G H H H H G H H A A H H H A H H G H A G H H H G A A G H H G G H H A G G A A H G A H H H
B7T/G         37366       Tv     T H G T H H T H H H H T H H G G H H H G H H T H G T H H H T G G T H H T T H H G T T G G H T G H H H
BC3C/T        38020       Ti     C T T C H H C H H H H C C T H H C T H T C H C C T C H H H C T T C T H C C H H T C C T T C C T H H H
BC4C/T        38149       Ti     C T T C H H C H H H H C T T T T H T H T C H C H T C H H H C T T C T H C C H H T C C T T H C T H H H
BC5C/T        38383       Ti     H T T C H T C H H H H C T T T T T T H T H H C H T C H H H C T T C T T C H H H T H C T T H C T H H H
BC6C/T        38409       Ti     H C C C C H C C C C C C C C C C H C C C C C C C C C C C C C C C C C H C H C C C H C C C C C C C C C
BC7G/A        38666       Ti     G H H G G G G H H G H G G H H H G G H H G G G G H G H H G G H G G G G G G H G H G G H H G G G H H G
BC8C/T        38940       Ti     C C C C C H C C C C C C C C C C H C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C
BC9A/G        39293       Ti     H G G A H G A H H H H A G G G G G G H G H H A H G A H H H A G G A G G A H H H G H A G G H A G H H H
C1A/T         39997       Tv     H T T H H T A H H H H A T T T T T T H T H H A H T A H H H A T T A T T H H H H T H A T T H A T H H H
C2C/A         40292       Tv     H A A H H A C H H H H C A A A A A A H A H H C H A C H H H C A A C A A H H H H A H C A A H C A H H H
C3T/C         40306       Ti     T C C T H C T H H H H T C C C C C C H C H H T H C T H H H T C C T C C T T H H C T T C C H T C H H H
C4A/T         41868       Tv     A H T A H H A H H H H A H H T T H H H T H H A H T A H H H A T T A H H A A H H T A A T T H A T H H H
C5A/G         41875      CTi     A H A H A A A A A A A A H H A A A H A A A A A A A A A A A A A A A H A H A A A A A A A A A A A A A A
C6C/T         41930       Ti     C H T C H H C H H H H C H H T T H H H T H H C H T C H H H C T T C H H C C H H T C C T T H C T H H H
C7G/A         42036      CTi     G G G G G H G G G G G G G G G G G H G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G
D1+/-         44495       ID     + + + + + + + H + + + + + + + H + + H + + + + + + + H + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + H +
D2G/T         45139       Tv     H T T H H T G H H H H G T T T T T T H T H H G H T G H H H G T T G T T H H H H T H G T T H G T H H H
E1G/T         48876       Tv     G H G H G G G G G G G G H H G G G H G G G G G G G G G G G G G G G H G H G G G G G G G G G G G G G G
E2-/+         49185       ID     H + + H H H - H H H H - + + + + H + H + H H - H + - H H H - + + - + + H H H H + H - + + H - + H H H
E3T/C         49258       Ti     T T T T T T T H T H T T T H T H T T H H T T T T H T H H T T T T T T T T T T T T T T T H T T T T H T
E4C/G         49345       Tv     C C C C H C C C C H C C C C C C C C C C C C C C H C C C H C H H C C H C C C H C C C C H C C H C C C
E5A/G         49387       Ti     A A A A A A A H A A A A A A A H A A H A A A A A A A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A H A
DS4A/G        50965       Ti     A A A A H A A A A H A A A A A A A A A A A A A A H A A A H A H H A A H A A A H A A A A H A A H A A A
DS6T/C        52807       Ti     C C C H C C T H H H H T C C C C C C C C H C T H C H H H H T C C T C C H C C H C H T C C H T C H C H
DS9T/C        55021       Ti     H C C H H C T H H H H T C C C C C C H C H H T H C T H H H T C C T C C H H C H C H T C C H T C H H H
DS14A/C       57853       Tv     C C C H C C H H H H H A C C C C C C C C H C A H C H H C H A C C A C C C C C H C C A C C H A C H C H
DS17A/C       59869       Tv     A A A A H H A A A H A A A A A A A H A A A A A A H A A A H A H H A A H A A A H A A A A H A A H A A A
DS20A/T       63524       Tv     A H T A H H A H H H H A A H H T A H H T A H A A T A H H H A T T A H H A A H H T A A T T A A T H H H
DS21G/T       64583       Tv     H T H H H H G H H H H G T T T T H T H T H H G H T G H H H G T T G T T H H H H T H G T T H G T H H H
DS23A/G       66353       Ti     A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A H A A A A A A A A A H A H A A A A A A A A H A A A H A A H
DS26G/A       68233       Ti     A A H H A H G H H H H G A A A A H A A A H A G H A H H H H G A A G A A H A H H A H G A A H G A H A H
H1G/T         71802       Tv     G G G G H G G G G H G G G G G G G G G G G G G G H G G G H G H H G G H G G G H G G G G H G G H G G G
H5A/C         72742       Tv     H A A A H A A A A A A A A A A A A A H A A H A A A H A A A A A A A A A A H A A A A A A A A A A A H A
H3G/A         73191       Ti     H G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G
DS31C/T       75194       Ti     H T H H H H C H H H H C T T T T H T H T C H C H T C H H H C T T C T T H H H H T H C T T H C T H H H
HA1G/A        75717       Ti     G G G G G G G H G G H G G H G H G G H H G G G G H G H H G G G G G G G G G G G G G G G H G G G G H G
HA2C/T        75929       Ti     C H C H C C C C C C C C H H C C C H C C C C C C C C C C C C C C C H C H C C C C C C C C C C C C C C
HA3C/T        77318       Ti     C C C C C C C H H C H C C H C H C C H H C C C C H C H H C C C C C C C C C C C C C C C H C C C C H C
HA4T/C        77699      CTi     C C H H C H T H H H H T C C C C H C C C H C T H C H H H H T C C T C C H C H H C H T C C H T C H C H
HA5A/T        77709       Tv     A T H H H H A H H H H A T T H H A T H T A H A A T A H H H A T T A T H H A H H T A A T T A A T H H H
H6C/A         78004       Tv     C C C C H C C C C H C C C C C C C C C C C C C C H C C C H C H H C C H C C C H C C C C H C C H C C C
HB1C/G        80100       Tv     C C C C H C C C C H C C C C C C C C C C C C C C H C C C H C H H C C H C C C H C C C C H C C H C C C
HB2T/C        80253       Ti     C C H H C H T H C H H T C C C C H C C C H C T H C H H H H T C C T C C H C H H C H T C C H T C H C H
HB3T/C        80281      CTi     T T T T T H T T T T T T T T T T T H T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T
HB4T/C        80420      CTi     H T T T H T T T T T T T T T T T T T H T T H T T T H T T T T T T T T T T H T T T T T T T T T T T H T
HB5-/+        80542       ID     + + H H + H - H + H H - + + + + H + + + H + - H + H H H H - + + - + + H + H H + H - + + H - + H + H
H8C/T         81796      CTi     H C C C H C C C C C C C C C C C C C H C C H C C C H C C C C C C C C C C H C C C C C C C C C C C H C
H9C/T         81919      CTi     C C C C H C C C C H C C C C C C C C C C C C C C H C C C H C H H C C H C C C H C C C C H C C H C C C
H10C/T        83221      CTi     H C C C H C C C C C C C C C C C C C H C C H C C C H C C C C C C C C C C H C C C C C C C C C C C H C
H11C/A        83358       Tv     H C C C H C C C C C C C C C C C C C H C C H C C C H C C C C C C C C C C H C C C C C C C C C C C H C
HC1G/A        83981       Ti     G H G H G G G G G G G G H H G G G H G G G G G G G G G G G G G G G H G H G G G G G G G G G G G G G G
HC2C/G        85056       Tv     C H C H C C C C C C C C H H C C C H C C C C C C C C C C C C C C C H C H C C C C C C C C C C C C C C
H12G/A        85170       Ti     G G H A G H A H G H H A G G G G H G G G A G A H G H H H H A G G A G G A G H H G H A G G H A G H G H
H13C/G        85418       Tv     C C C C C H C C C C C C C C C C C C G C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C
H22A/G        87154       Ti     H A A A A A A A A A A A A A A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A H A A A A A
H23A/G        87229       Ti     H A A A A A A A A A A A A A A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A H A A A A A
HD2G/C        88732       Tv     C C H H C H G H H H C G C C C C H C C C G C G H C ? H H H G C C G C C H C H H C H G C C H G C H C H
HD3C/A        89298       Tv     A A H H A A C H H H H C A A A A A A A A H A C H A ? H H H C A A C A A H A A H A H C A A H C A H A H
Jjh12G/C      90621       Tv     H G G G H G G G G G G G G G G G G G H G G C G G G H G G G G G G G G G G G H G G G G G G G G G G H G
JJ1G/A        93444       Ti     H G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G
JJ3T/A        94019       Tv     A H T H A H T H H H H T A A H A H A A H H A T H A H H H H T H A T A A H A T H T H T H A H T A T A H
JJ4T/C        94225       Ti     H T T T T H T T T T T T T T T T T H T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T
JJ5C/A        94679       Tv     C C C C C H C C C C C C C C C C H C C C C C C C C C C C C C C C C H C C H C C C C C C C C C C C C C
JJ6T/C        95104       Ti     H H T H H H H H H H T H C H H C H C H H T H T C C T H H C T H C T C C H H T H T H T H H H H C T H H
JJ7A/C        95163       Tv     H A A A H H H H H H A H H A A C A H H H A H A H C A H H C A H C A H C A H A H A H A H H H H C A H H
J8A/G         95724       Ti     A A A A A A H A A A A H A A A H A A A A A H A H A A A A H H A H H ? A A A A A A A A H A A H H A A G
J1A/T         95726       Tv     A H A H A A A A A A A A H H A A A H A A A A A A A A A A A A A A A T A H A A A A A A A A A A A A A A
J2A/G         95865       Ti     G A A A G H A A A H A A H A A A A H H A H H A A H H A A H A H H A A H A H A H A A A A H A A H A H A
J3A/G         96041       Ti     G H A H G H H H G H A H H H H G H G G H A G A G G H H H G H H G H G G H G A H A H A H H H H G A G H
J4A/G         96128       Ti     G H A H G H H H G H A H G H H G H G G H A G A G G H H H G H H G H G G H G A H A H A H H H H G H G H
J13C/T        97182      CTi     C C C C C C T H H C C H C C C C H C C H C C C C H C C T C C C H C C C H C C C H H C H C C H H C C C
J14G/C        97651       Ti     G G G G G G G H G G G G G G G H G G H G G G G G G G H G G G G G G G H G G G G G G G G G H G G G H G
Jjk1C/T       97764      CTi     C C C C C H C C C C C C C C C C C C C C H C C C C C C C C C C C C H C C C H C C C C C C C C C C C H
Jjk2C/T       97831      CTi     C C C C C C T H H C C H C C C C H C C H C C C C H C C T C C C H C C C H C C C H H C H C C H H C C C
Jjk13G/A      98414       Ti     G G G G G G A H H G G H G G G G H G G H G G G G H G G A G G G H G G G H G G G H H G H G G H H G G G
Jjk15T/C      98757       Ti     T T T T T T C H H T T H T T H T C T T H T T T H H T T C T T T H T T T H T T T H H T H T T H H T T T
Jjk16G/C      98792       Tv     G G G G G G C H H G G H G G H G C G G H G G G H H G G C G G G H G G G H G G G H H G H G G H H G G G
Jjk3G/A       98977       Ti     G G G G G G H H H G G H H G H G H G G H G G G H H G H A G G G G G G H H G G G H H G G G G H G H G G
Jjk5T/C       99046      CTi     H H H C H C T H H C H H C C T C T C H T C H C H H H H T C C H C C C H H H H C H H H T C C H H C H C
Jjk9C/T       99113      CTi     H H H T H T C H H T H H T T C T C T H ? T C H C H H H C H T H T T H H H H H T H H H C T T H H T H H
Jjk4G/A       99122       Ti     G G G G G G G H G G G H G G H G H G G H G G G H H G H H G G G G G G H G G G G H G G G G G H G G G G
Jjk18G/C      99148       Tv     H H H C H C G H H C H H C C G C G C H G C G H H H H H G C C H C C H H H H H C H H H G C C H H C H H
Jjk14G/A      99163       Ti     H H H A H A G H H A H H A A G A G A H G A G H H H H H G A A H A A H H H H H A H H H G A A H H A H H
Jjk10C/T      99336      CTi     H C C C H C C H C H C C C C C C C C H H C H C C H H H H C C C C C C H C H C C H C C C H C H C C H C
Jjk11+/-      99380       ID     + H + H + + + + + + + + H H + + + H + + + + + + + + + + + H + + H H + H + + + + + + + + + + + + + +
Jjk12+/-      99397       ID     + + + + + H + + + + + + + + + + + H + + + + + + + + + + + + H + + + + + + + + + + + + + + H + + + +
Jjk6G/A       99445       Ti     G G G G G H G G G G G G G G G G G G H G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G H G G G G
Jjk7G/C       99627       Tv     G G H G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G
Jjk8C/G       99748       Tv     C H H H C H C H C H C C H H H C H H C H C C C C G C H H C H G H H H G H C H C H C H C H C H G H C C
J5C/T        100281      CTi     H C H H T C H C C T C H C H H C H C H H H H C C H T C C C C T H C C H C H H H C C H H H C C H H H H
J6G/A        100470       Ti     G A G H G A H H A G A H H H G G G A G H H H A H H G H A A A G H A A G A G H H A H H G H H A H G G H
J7C/T        100629       Ti     T T T T T C H T T T C H T H T T T H T T H T H T T T T H T H T T H T T H T T H T H T T T H H T T T T
JK4T/C       103442      CTi     T C T H T C C H H T C H H H T T T C T H H H C H H T H C C C T H C C T C T H H C H H T H H C H T T H
Kk3G/C       110885       Tv     C C C C C H C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C
Kk4A/T       110909       Tv     A A H A A A A A A H A A A A H A H A A A A A A A H A A A A A T H A A H A A A A A A A A H A A H A A A
Kk5G/C       111204       Tv     C G C H C G H H H C G H H H C C C G C H H H G H H C H G G G C H G G C G C H H G H H C H H G H C C H
K1G/C        119361       Tv     G G H G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G
K3T/C        120299      CTi     T H T H T T T T T T T T H T T T T H T T T T T T T T T T T H T T H H T H T T T T T H T T T T T T T T
K5A/G        128910       Ti     G G G G G H G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G
K7C/T        130067      CTi     C T C H C C C H H C C C H C C C C T C H C H H C H C H H C H C C H T C H C H C T C H C H C T H C C H
K8G/A        130731      CTi     A G A H A G H H H A G A H A A A A G A H H H G A H A H G A G A A G G A G A H A G H H A H H G H A A H
L1C/G        144388       Tv     G C G H G C H H H G G G H G G G G H G H G H C G H G H C G H G G H C G C G H G C H H G H G C H G G H
L3T/C        144554       Ti     H T T T T T T T T T H H T H T T T H T T T T T T T T T T T T T T T T T T H T H T H T T T H T T T T T
L4G/A        144647       Ti     H G G G G G G G G G H H G H G G G H G G G G G G G G G G G G G G G G G G H G H G H G G G H G G G G G
L5C/T        145031       Ti     H C C C C C C C C C H H C H C C C H C C C C C H C C C C T C C H C C C C H C H C H C C C H C C C C C
M1G/A        164994       Ti     H G G H A G H G H H G H G H G G G G H H H H G G G A G G G G G G G G G G H G H G G H G G G G G H H H
M2T/C        165497       Ti     H C T H T H T H H T H T H T T T T C T H H H H H H T H H C C T H C C T H H H H C H H T H H C H T T H
M5G/T        166360       Tv     H T G H G H G H H G H G H G G G G T G H H H H G H G H H ? T G G T T G H H H G T H H G H G T H G G H
T1G/T        190501       Tv     G T G H G H H T H G H H H H G H G H H H G H T G H G T T G H G G H T G T G H G T H H H H H T H G H H
T2C/T        190648      CTi     C T C H C T H T H C H H H H C H C H H H C H T C H C T T C H C C H T C T C H C T H H H H H T H C H H
T3C/T        191492       Ti     H C T H T C H C H T C H H C T H T H H H H H C H H T C C C C T H C C T C H H T C C H H H H C H T H H
T4A/T        192204       Tv     T A T H T A H A H T T T H T T H T H H H T H A T H T A A T H T T H A T A T H T A H H H H H A H T H H
T5G/A        192234       Ti     G H G H G G G G G G G G H G G G G H G G G G G G G G G G G H G G H H G H G G G G G H G G G G G G G G
T6C/T        192271       Ti     T C T H T C H C H T C H H H T H T H H H H H C H H T C C C C T H C C T C T H T C H H H H H C H T H H
T7G/C        192278       Tv     G C G H G C H C H G C H H H G H G H H H H H C H H G C C C C G H C C G C G H G C H H H H H C H G H H
T8G/A        192774      CTi     G A G H G A H A H G G G H G G H G H H H G H A G H G A A G H G G H A G A G H G A H H H H H A H G H H
T9C/A        192937       Tv     A C A H A C H C H A A A H A A H A H H H A H C A H A C C A H A A H C A C A H A C H H H H H C H A H H
T10C/T       193139       Ti     C T C H C T H T H C H C H C C H C H H H H H T C H C T T C T C C T T C T C H C T H H H H H T H C H H
T11G/A       193147       Ti     G A G H G A H A H G G G H G G H G H H H G H A G H G A A G H G G H A G A G H G A H H H H H A H G H H
T12C/T       193262       Ti     T C T H T C H C H T H T H T T H T H H H H H C H H T C C C C T H C C T C T H T C H H H H H C H T H H
T13G/A       193332       Ti     G A G H G A H A H G G G H G G H G H H H G H A H H G A A A H G H H A G A G H G A H H H H H A H G H H
T14G/A       193604       Ti     A G A H A G H G H A H A H A A H A H H H H H G H H A G G G G A H G G A G A H A G H H H H H G H A H H
T15G/C       194255       Tv     G C G H G H H C H G G G H G G H G H H H G H C G H G C C G H G G H C G C G H G C H H H H H C H G H H
T16G/A       194418       Ti     G A G H G H G H H G G G H G G G G H G H G H H G H G H H ? ? G G A A G H G H G A G H G H G A H G G H
T17G/A       194676       Ti     A G A H A H H H H A H G H H A H A H H A A H G A A A H H A H A A H G A G A G H A H H H H H G A A H G
T18C/T       194791       Ti     C T C H C H H H C C T T T T H T T H H C H C T H C C H H C T C C T T C T H T T C T H H H H T C H H H
T19C/T       194816       Ti     H C T H T H H H H T C C C C H C C H H T H H C C T T H C C C T H C C T C H C C T C H H H H C T H H C
T20aC/T      194844       Ti     H T C H C H H H H C T T T T H T T H H C H H T T C C H H T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
T20bA/G      194846       Ti     H A G H G H H H H G A A A A H A A H H G H H A A G G H H A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
T21C/T       194927       Ti     H C C C C C H H H C T H C T C H C C H C H H H H C C H H T H C H H C C H C C C C H C H C H C C C H H
T22G/A       195038       Ti     G A A A H A A A A A A A A A A A A A H A A H A A A H A A A A A A A A A A H A A A A A A A A A A A H A
T23C/T       195155      CTi     C H C H C C H H H C C T H H C H C H H C H H T C C C H H C T C C T H C T C H H C H H H C H H C C H T
T24A/T       195172       Tv     H T A T H A T H A H H H T T H T T H H H T H H T A H H T T T A H T T A T A T H A H T H H H H A T H H
T25C/T       195311       Ti     H C H C H T C H H H H C C C H C C H H H C H C C T H H C C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
T26T/A       195344       Tv     T H T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
T27G/A       195426      CTi     H A H A G G A H H H H H H A G H G H H H A H H G G H H A G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
T28C/T       195441      CTi     H T H T C C T H H H H H H T C H C H H H T H H C C H H T C T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
T29aA/C      195506       Tv     H C H C A A C H H C H H H C H H H H H H C H H A H H H C A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
T29bT/C      195508       Ti     H C H C T T C H H C H H H C H H H H H H C H H T H H H C T C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
T30C/A       195655       Tv     A A A A H A A A A A A A H A H H H A A A A A A H A A A A A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
T31T/C       195885       Ti     H T C H H C H C C H H C T C T H H H C C H H C T H C C H T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
T32A/T       196317       Tv     A A A A A A A H A A A A A A A H A A H A A A A A A A H A A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
T33A/G       196905      CTi     H H H G H H H H G H A G H G A H H G G H H H G A A G H H A H A H H G H H G H G A H G G A G H A H G H
T34G/A       196918       Ti     G G H H G G H G G H G H G A G G G G G H H G G G G H G H G G G G G H G G G G G G G H H G H G G H G G

T35+/-       197010       ID     + H + H + + + + + + + + H + + + + H + + + + + + + + + + + H + + H H + H + + + + + H + + + + + + + +
T36aG/T      197372       Tv     G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G H G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G H
T36bG/A      197374       Ti     A A A A H A A A A A A A H A H H H A A A A A A H A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A H A H
T37C/A       197522       Tv     H H H A H H H H A H C H H A C H C A A H H H A C C A H H C H C H H A H H A H A C H A A C A H C H A H
T38G/A       197716      CTi     G H G H G G G G H G G G H G G G G H G G G G H G G G G G G H G G H H G H G G H G G H G G G G G G G G
T39-/+       197887       ID     H H H + H H H H + H - H H + - H - + + H H H + - - + H H - H - H H + H H + H + - H + + - + H - H + H
T40G/A       198854       Ti     G G H G G H G H G G H H G G G G G G G H G G G G H G H G G G G G G G G G G G G A G G G G G G H G G G
T41G/A       199313      CTi     G H G G G G G G G G H G G G G G G G G G H H G G G G G G G H G G H G G H G H G G G G G H G H G G G H
T42G/T       199501       Tv     H G G G H H G G H G G G G G G G G H H G G H H G G H G G G G G H G G G G T H H G H G G G G H G G H H
T43A/G       199802       Tv     A H A A A A A A A A H A A A A A A A A A H H A H A A A A G H A H H A A H A H A A A A A H A H A A A H
T44A/C       199880       Tv     A H A H A A A A A A A A H A A A A H A A A A A A A A A A A H A A H H A H A A A A A H A A A A A A A A
T45C/T       200052       Ti     H C C C H H C C H C C C C C C C C H H C C H H C C H C C C C C H C C H C T H H C H C C C C H C C H H
T46T/C       200568      CTi     T T T T T T T H T T T T T T T H T T H T T T T T T T H T T T T T T T T T T T T T T T H T H T T T H T
T47G/A       200936       Ti     H G G G H H G G H G G G G G G G G H H G G H H G G H G G G G G H G G H G A H H G H G G G G H G G H H
T49T/G       201375       Tv     T T H H T T H T T H T T T H T T T T T T H T T T T H T H T T T T T H T T H T T T H T H T H T T H T T
T51T/C       201849      CTi     T H H C H C H H H H H C H H H T T C T C H T H T H H H H T H H H H H T H H H H C H C H T T H H H T H
U1T/C        210241      CTi     T T T H T H H C H T H H T T T H T T H C H T T T T H C H T T T T T T T T H T T C H T C T H T H H H T
U2C/T        210333       Ti     C C C C C C C H C C H H C C C C C C C T C C C C C C H C C C C C C C C C C C C T C C C C C C H C C C
U4T/C        213653       Ti     T T T T H T T T T T T T T T T T T H T T T T H T T T T T T T T T T H T T T T H T T H T T H H T T T H
U5C/A        213817       Tv     C H C H C H H A H C A A C A C H C C H A A C C H H H A H A H C H H C C H H H H A H C A H H H H H H C
U6A/G        214007       Ti     A A A H A H H H H A H A A H A H A A H A G A A A A H H H A H A A H A A H H A A A H A G A H A A H H A
U7C/T        215332       Ti     C H C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C
U8C/A        215648       Tv     C C C H C H H A H C A H C H C H C C H A A C C C C H A H C H C C H C C H H C C A H C A C H C H H H C





[University Home] [Faculty of Medicine and Biological Sciences Home] [Department of Genetics Home] [Staff member home page] [University Index A-Z][University Search][University Help]
Last updated: 8 September, 2005
Celia A. May
The views expressed in this document are those of the document owner, Alec J. Jeffreys.